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Illumina — Technical Presentation (2019)

57 slides from Illumina's technical presentation, 2019

  1. Slide 1: ランを成功させるための最適なクラスター密度を得る方法

    ランを成功させるための 最適なクラスター密度を得る方法 イルミナ株式会社 Field Applications Scientist 福世 裕貴子 © 2019 Illumina, Inc. All rights reserved. For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  2. Slide 2: 本ウェビナーのゴール

    本ウェビナーのゴール クラスタリング クラスター密度 に関する問題が に影響を与える あったときの 要素とは？ 診断方法 最適なクラスター密度 を得る方法 2

  3. Slide 3: 本ウェビナーのアジェンダ

    本ウェビナーのアジェンダ 1 クラスター形成とは？クラスターとは？ 最適なクラスター密度の重要性とは？ 2 - Overclustering と Underclusteringが与える影響 - 3 一般的にみられるクラスタリングに関する問題への回避策 4 ランダムフローセルにおける最適なクラスタリングの診断方法 5 パターン化フローセル（ iSeq・NovaSeq ） 6 サポート資料 3 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  4. Slide 4: 本ウェビナーのアジェンダ

    本ウェビナーのアジェンダ 1 クラスター形成とは？クラスターとは？ 最適なクラスター密度の重要性とは？ 2 - Overclustering と Underclusteringが与える影響 - 3 一般的にみられるクラスタリングに関する問題への回避策 4 ランダムフローセルにおける最適なクラスタリングの診断方法 5 パターン化フローセル（ iSeq・NovaSeq ） 6 サポート資料 4 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  5. Slide 5: Illumina Sequencing Workflow

    次世代シーケンサーでデータを得るまでの4つの工程 Illumina Sequencing Workflow Library Preparation ライブラリー調製 Cluster クラスター形成Generation Sequencing シーケンシング データ解析 Data Analysis 5

  6. Slide 6: 次世代シーケンサー(NGS)でデータを得るまでの4つの工程

    次世代シーケンサー（NGS）でデータを得るまでの4つの工程 Illumina Sequencing Workflow Library Preparation ライブラリー調製 Cluster クラスター形成Generation Sequencing シーケンシング データ解析 Data Analysis 6

  7. Slide 7: クラスター形成とは

    クラスター形成とは クラスター形成の目的は？ 調製したライブラリーのDNA量だけではシーケンシングで検出する際に量が不十分なため、 PCR増幅をフローセル（流路をもったガラス基板）上で行うことにより検出に十分なDNA量を確保する クラスターとは？ フローセルの表面上で断片化されたライブラリーが増幅された領域 フローセル クラスター =1分子由来のライブラリーの束 7

  8. Slide 8: クラスター形成に使われるフローセルとは?

    クラスター形成に使われるフローセルとは？ 流路を持ったガラス基板で、クラスター形成が行われる場所 ランダムフローセル パターン化フローセル • HiSeq 2500, MiSeq, NextSeq, MiniSeq • HiSeq 3K/4K/X, NovaSeq, iSeq 100 •クラスタがランダムな位置で増幅される •サイズと位置が決定 •インサート長対応の柔軟性 •クラスタの高密度化 • Duplication率が低い •イメージングを簡略化 8

  9. Slide 9: クラスター形成とは

    クラスター形成とは - 多数のクラスターがフローセルの表面上に形成される - Read1シーケンシングプライマーが結合し超並列でシーケンシングが開 始される - 1クラスター= 1リード 例： 10,000クラスター= 10,000リード 9

  10. Slide 10: どうやってクラスターの画像取得が行われるのか?

    どうやってクラスターの画像取得が行われるのか？ - クラスターは、Read1シーケンシングプライマーが適切に 結合されている状態でのみ確認することができる - 最初の1塩基が取り込まれると、画像取得が開始される - クラスターが検出されると、シーケンサーは Sequencing By Synthesis(SBS)法を利用し伸長反応を進める 10

  11. Slide 11: Sequencing By Synthesis

    Sequencing By Synthesis 伸長反応- Sequencing by (SBS) Synthesis Example with four channel chemistry MiSeq HiSeq G T T T T A C A 蛍光色素付 蛍光色素付NTPが励起され画像取得が NTPからブロックと蛍光色素 NTP’s + ポリメ 行われる (4 画像/塩基) が取り除かれる ラーゼを加える X # of bp in read 11

  12. Slide 12: 取得した画像解析から塩基情報を決定するまで

    取得した画像解析から塩基情報を決定するまで シーケンシング中に、Real-time analysis software (RTA software)が装置内 で自動で立ち上がり得られたクラスターの画像データから主に下記の工程を行 い最終的に塩基情報を決定する フローセル上のクラスター密度がRTAの解析の下記工程に影響を与える 蛍光強度 クラスター品質による選別 クラスターの位置決め （インテンシティー） (Passing Filter) の抽出 12 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  13. Slide 13: クラスターの位置決め

    クラスターの位置決め - ランダムフローセルの場合は、ライブラ リーがフローセルに流入した際にランダ ムにフローセル上に結合しその後クラス ターを形成する クラスターが形成される場所がランダム なため最初にクラスターの位置を探す工 程が必要になる - RTAは最初の4~7サイクルでクラスターの 位置を特定する - 位置の特定後、次の補正の工程に進む - iSeq、NovaSeqで使用されるパターン化 フローセルは整列されたウェルの中にク ラスターが形成されるのでクラスターの 位置決めの工程は不要 13

  14. Slide 14: 蛍光強度(インテンシティー)の抽出

    蛍光強度（インテンシティー）の抽出 クラスターの位置決めをした後、各クラスターの蛍光強度を抽出しクラスターの分離を行う 各クラスターの バックグラウンドの 各クラスターの 蛍光強度から 蛍光強度を計算 蛍光強度を計算 バックグラウン ドを引く 実際のクラスター 蛍光強度が低く暗い 各クラスターの蛍光強 抽出した各クラス は上記のように完 ピクセルの平均値を 度が高く最も明るいピ ターの蛍光強度から 璧な円状ではない 使ってバックグラウ クセルを用いてクラス バックグラウンドの ンの蛍光強度を計算 ターの蛍光強度を抽出 蛍光強度を引く する する 14

  15. Slide 15: クラスター品質による選別 Passing Filter

    クラスター品質による選別 Passing Filter Passing Filterは、重なり合って分離ができなかったクラスターのような純度 の低いクラスターを取り除く役割がある - 塩基伸長が始まって1塩基目～25塩基目で、蛍光強度の抽出結果に基づき 純度の低いクラスターをふるい落とす - Passing Filterを通った純度の高いクラスターのみデータ収量として考慮 され、塩基決定の精度を表すスコア（Q30）に貢献する 15

  16. Slide 16: 本ウェビナーのアジェンダ

    本ウェビナーのアジェンダ 1 クラスター形成とは？クラスターとは？ 最適なクラスター密度の重要性とは？ 2 - Overclustering と Underclusteringが与える影響 - 3 一般的にみられるクラスタリングに関する問題への回避策 4 ランダムフローセルにおける最適なクラスタリングの診断方法 5 パターン化フローセル（ iSeq・NovaSeq ） 6 サポート資料 16 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  17. Slide 17: なぜクラスター密度のコントロールが重要なのか?

    なぜクラスター密度のコントロールが重要なのか？ クラスター密度は画像解析から塩基情報の決定を行う際の工程で大きな影響を与 えるため、最終的なデータの品質とデータの収量に密接に結びついている 最適なクラスタ密度でランを行う上でoverclusterとunderclusterの間のバラン スのよい密度を見つけることが重要 目標はoverclusterを避けて適切なSignal/ Noise比を確保しつつ、十分なデータ 量を確保できるくらいクラスター密度を高くする 低 クラスター密度の状態 高 Underclustering 最適な密度 Overclustering 17 For Research

  18. Slide 18: OverclusteringとUnderclusteringがもたらす影響

    OverclusteringとUnderclusteringがもたらす影響 Overcluster – クラスターが多すぎる状態 原因 ライブラリーのローディング量が多い ・ Q30スコアの低下 症状 ・ Cluster Passing Filterの低下 ・ インデックスの振り分け(demultiplexing)不良 ・ ランが止まる Undercluster – クラスターが足りない状態 原因 ライブラリーのローディング量が少ない ・ 最終的なデータ収量が非常に少ない 症状 ・ ただしデータの質は良好なことが多い 18

  19. Slide 19: 装置別 推奨のクラスター密度

    装置別 推奨のクラスター密度 装置 シーケンシング用試薬 推奨クラスター密度 (K/mm2) HiSeq 2500 (High Output) HiSeq v4 950 – 1050 TruSeq v3 750 – 850 HiSeq 2500 (Rapid Run) HiSeq v2, TruSeq(v1), Rapid Duo 850 – 1000 MiniSeq MiniSeq High/Mid Output 170 – 220 MiSeq MiSeq v3 1200 – 1400 MiSeq v2 1000 – 1200 NextSeq High/ Mid Output (v2.5 a

  20. Slide 20: 本ウェビナーのアジェンダ

    本ウェビナーのアジェンダ 1 クラスター形成とは？クラスターとは？ 最適なクラスター密度の重要性とは？ 2 - Overclustering と Underclusteringが与える影響 - 3 一般的にみられるクラスタリングに関する問題への回避策 4 ランダムフローセルにおける最適なクラスタリングの診断方法 5 パターン化フローセル（ iSeq・NovaSeq ） 6 サポート資料 20 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  21. Slide 21: 一般的にみられるクラスタリングに関する問題への回避策

    一般的にみられるクラスタリングに関する問題への回避策 ライブ ライブ ラリー ラリー の品質 の定量 装置へロー ExAmp ディングす 塩基の る際の最終 Reagent 多様性 の調整 濃度 21

  22. Slide 22: ライブラリーの品質

    ライブラリーの品質 ライブラリーの品質が影響を与える理由 - ライブラリー調製の際に残ったアダプターダイマー、プライマーダイマーがライブラリー 定量やクラスター形成に影響を与える - ライブラリーの精製が不十分だと、上記のコンタミネーションが残る可能性が高い 推奨の定性確認・ライブラリー精製方法 各ライブラリー調製キットのガイドに従った方法でライブラリーの定性確認、およびライブ ラリーの精製を行う - 定性確認方法の例：Bioanalyzer, Fragment Analyzer - 精製方法の例： AMPure Beads ライブラリーのモル濃度の計算に使用するため、平均ライブラリーサイズを

  23. Slide 23: ライブラリーの定量

    ライブラリーの定量 精度の高いライブラリー定量が最適なクラスター密度のコントロールには不可欠 qPCR Qubit/ PicoGreen Bioanalyzer • ライブラリーのサイズ • ライブラリーのサイズ • TruSeq Small RNA, 分布が近似している場 分布がブロードなライ TruSight Tumor 26, 合は最も効果的な定量 ブラリーに効果的 TruSeq Targeted 方法 RNA Expressionの3 • アダプターダイマーを 種類では測定可能 • 両端にアダプター付加 含めたすべての二本鎖 された構造的に問題な DNAを測定する恐れ いライブラリーの

  24. Slide 24: 装置へローディングする際のライブラリー最終濃度

    装置へローディングする際のライブラリー最終濃度 ライブラリー調製後、ライブラリーはライブラリーの種類、装置、シーケンシング用 試薬に合わせて適切に最終濃度に希釈する必要がある 最終濃度を 誤ってしま • 高濃度だとoverclusterになる可能性大 → Cluster Passing Filter低下、ラン不良 うと起こる • 低濃度だとunderclusterになる可能性大→ データ収量が低下、データ精度低下 こと • 装置へローディングする際の濃度を少しずつ調整していくことがお勧め 最適な最終 • 装置ごとに推奨のライブラリー最終濃度が異なるため下記ガイドを参照する 濃度を決定 - Th

  25. Slide 25: 塩基の多様性

    塩基の多様性 塩基バランスのよいライブラリー TEMPLATE CGAT CYCLE 1 CYCLE 2 CYCLE 3 12個のクラスターが CYCLE 4 認識される それぞれのクラスターが異なる配列を持つので、サイクルごとに異なるシグナルが得られる 隣り合ったクラスターを区別することができる 塩基の多様性が乏しいライブラリー（例：PCRアンプリコン） TEMPLATE CGAT CYCLE 1 CYCLE 2 CYCLE 3 CYCLE 4 12個のクラスターが - ローディングする際の最終濃度を低くする 物理的にクラスターの重なりを低減させる 8個と認識される - PhiXや塩基の多様

  26. Slide 26: 塩基の多様性

    塩基の多様性 下記の装置別のPhiX Spike-inの推奨量を参考にしてspike-inを行う 最初はspike-inを多めにし、徐々に様子を見ながら少な目に調整していくとよい 26 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  27. Slide 27: 塩基の多様性に関するウェビナー

    塩基の多様性に関するウェビナー https://jp.illumina.com/events/webinar/2019/webinar-191120-j.html 27 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  28. Slide 28: ExAmp Reagentの調整

    ExAmp Reagentの調整 HiSeq3000/4000、NovaSeqではマニュアルでExAmp Reagentを調整する必要があるが、 誤った調整方法は結果に影響を与える 調整の際の注意点 - ExAmp reagentは粘性が高いので、混ぜる際はゆっくりピペッティングするよう注意する - ExAmp reagentが劣化しないように、調整後フローセルに載せるまでに長い時間置かない ようにする - NovaSeq Xp workflowの場合は、フローセルにExAmp reagentとlibrary mixのMixtureを ローディングした後ランを開始するまでに時間が空いてしまうと

  29. Slide 29: 本ウェビナーのアジェンダ

    本ウェビナーのアジェンダ 1 クラスター形成とは？クラスターとは？ 最適なクラスター密度の重要性とは？ 2 - Overclustering と Underclusteringが与える影響 - 3 一般的にみられるクラスタリングに関する問題への回避策 4 ランダムフローセルにおける最適なクラスタリングの診断方法 5 パターン化フローセル（ iSeq・NovaSeq ） 6 サポート資料 29 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  30. Slide 30: ランダムフローセルとは?

    ランダムフローセルとは？ - HiSeq 2500, MiSeq, NextSeq, MiniSeq - クラスターがランダムな位置で増幅される - ランダムな位置でクラスター形成が行われるため、 overclusterになるとクラスター同士の重なりが 多発する可能性が高くなる - 塩基決定のための補正が問題なく行われるために はクラスター密度のコントロールが重要な要素に なる - ランの状態を適切に確認し調整を行う必要がある 30

  31. Slide 31: シーケンシングランがうまくいったかどうかの確認方法

    シーケンシングランがうまくいったかどうかの確認方法 イルミナでは主にシーケンシングランの状態を確認するためのツールを２つご用意 Illumina Sequencing Analysis BaseSpace Sequence Hub Viewer (SAV) • 装置上にインストールされている • 当社が展開しているクラウドサー ラン結果確認用ソフウェア ビス • ご自身のPC（Windowsのみ）に • ランデータを転送しネットワーク インストールしてご使用も可能 上で解析のモニタリングが可能 31 For Research Use Only. Not for use in diagnosti

  32. Slide 32: Sequence Analysis Viewer (SAV)を使用する際に必要なファイル

    Sequence Analysis Viewer (SAV)を使用する際 に必要なファイル ランフォルダ ∟ InterOp RunInfo.xml RunParameters.xml 32

  33. Slide 33: クラスター密度の問題同定に役立つランパラメーター

    クラスター密度の問題同定に役立つランパラメーター 代表的な 代表的な ランパラメーター* トラブルの原因 %>=Q30 ライブラリーの濃度 Cluster PF が適切でない Density %Aligned** * いずれも25サイクル目の画像解析後に表示 ** サンプルにPhiXを混合した場合のみ計算・ 表示 33

  34. Slide 34: %>=Q30: 決定した塩基の信頼性を示すスコア

    %>=Q30: 決定した塩基の信頼性を示すスコア ● Quality Scores (Q Score) Q Score % Error %Correct - 決定された塩基が正しい確率 Q10 10% 90% - 高い値 ≒ 高い信頼性 Q20 1% 99% - 塩基ごとに計算 Q30 0.1% 99.9% - 計算式: −10×log10Perror Q40 0.01% 99.99% ● %>=Q30 - >=Q30が割り当てられた塩基 の割合 - リード長に応じた基準値で、 ランの品質を確認可能 34

  35. Slide 35: Cluster Passing Filter

    Cluster Passing Filter Passing Filterは、重なり合って分離ができなかったクラスターのような純度 の低いクラスターを取り除く役割がある - 塩基伸長が始まって1塩基目～25塩基目で、蛍光強度の抽出結果に基づき 純度の低いクラスターをふるい落とす - Passing Filterを通った純度の高いクラスターのみデータ収量として考慮 され、塩基決定の精度を表すQ30のスコアに貢献する SAVでのCluster PFは純度の高いクラスターが全体のクラスターの内 何%存在していたかを表わす指標 35

  36. Slide 36: SAV Summary Tabの確認

    SAV Summary Tabの確認 SAV上のSummaryタブを確認する 1 Aligned (%) Summary Tab - PhiXをSpike-inした時のみ数値が表示される - PhiXの参照配列とどの程度アライメントが取れたのか がわかる - 25% spike-inした場合は通常25%に近い値を取る 1 低く表示されたとき： 実サンプル由来のライブラリー濃度が過剰である可能 性がある 通常はOverclusterである可能性が高い 高く表示されたとき： 実サンプル由来のライブラリーの濃度が低すぎる可能 性がある Underclusterである可能性が高い 2 3 2 Dens

  37. Slide 37: SAV Imaging Tabの確認:クラスター画像

    SAV Imaging Tabの確認：クラスター画像 各装置によってクラスター画像の見え方は異なるが、実際のクラスターの画像を確認可能 下記はMiSeq v2試薬でランした際のクラスター画像 正常な場合の例 推奨クラスター密度の範囲で一番高い状態の例 Overclusterの例 Overclusterでサチュレーションを起こしている例 37 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  38. Slide 38: SAV Analysis Tabの確認:蛍光強度の低下

    SAV Analysis Tabの確認：蛍光強度の低下 SAV上のAnalysisタブにあるData By CycleをIntensityに変更して確認する Overclusterで クラスター密度が正常な時の例 ランが失敗した時の例 Overclusterの結果クラスターの位置決めができず MiSeq V2試薬を使用した際の例 全塩基で最初の数サイクルで蛍光強度が下がって 通常はこのようにスパイクのない曲線がみられる しまうことがある 38 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  39. Slide 39: SAV Analysis Tabの確認:%>=Q30の低下

    SAV Analysis Tabの確認：%>=Q30の低下 SAV上のAnalysisタブにあるData By Cycleを%>=Q30に変更して確認する OverclusterでRead2開始後 OverclusterでRead2開始前の再合成で クラスター密度が正常な時の例 ランが止まってしまった例 Overclusterが悪化した例 Read1 Read2 - OverclusterはRead1とRead2いずれにも影響を与えるが、Read2がより影響を受ける傾向にある - Read2のシーケンシング開始前に数サイクルDNAの再合成を行う際に、クラスターのサイズが大きくなり クラスター同

  40. Slide 40: SAV Analysis Tabの確認:Cluster Pass Filterの低下

    SAV Analysis Tabの確認：Cluster Pass Filterの低下 SAV上のAnalysisタブにあるData By Laneを確認する 青ボックスプロットは形成されたすべてのクラスターの数、緑ボックスプロットは純度の高いクラスター （＝filterをパスした配列情報決定に使用されるクラスター）の数を表している 最適なクラスター密度の時 Overclusterの時 ひどくOverclusterの時 生のクラスター数と純度の高いクラス 補正がうまくいかず純度の高い ひどいoverclusterになると ターの数が近い クラスターの数が少なくなる 純度の高いクラスターがなくなる

  41. Slide 41: 本ウェビナーのアジェンダ

    本ウェビナーのアジェンダ 1 クラスター形成とは？クラスターとは？ 最適なクラスター密度の重要性とは？ 2 - Overclustering と Underclusteringが与える影響 - 3 一般的にみられるクラスタリングに関する問題への回避策 4 ランダムフローセルにおける最適なクラスタリングの診断方法 5 パターン化フローセル（ iSeq・NovaSeq ） 6 サポート資料 41 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  42. Slide 42: パターン化フローセルとは?

    パターン化フローセルとは？ - パターン化フローセルは数百万以上の整列された ウェルから構成される - 整列したウェル中にクラスターが形成される仕組 みになっており、クラスターのサイズとクラス ター間の幅が予めコントロールされているため overclusterにはなりにくい構造になっている - 構造的にはoverclusterにならないためランダム フローセルのように厳密なクラスター密度のコン トロールは不要だが、良好な結果を得るためには ライブラリーのローディング量を適正にコント ロールする必要がある - 適切なローディング量を確認するための項目： ・ Cluster Passing Fil

  43. Slide 43: Cluster Passing Filter(%PF)

    Cluster Passing Filter(%PF): 塩基を決定できるクラスター数の指標 %PFが高いと、1回のランでより多くの塩基配列を決定できる 空のウェル ポリクローナルウェル モノクローナルウェル PF Total Wells PF数 %PF = 43 Total Wells数

  44. Slide 44: Cluster Passing Filter(%PF)

    Cluster Passing Filter(%PF): 塩基を決定できるクラスター数の指標 %PFが高いと、1回のランでより多くの塩基配列を決定できる 空のウェル ポリクローナルウェル モノクローナルウェル PF Total Wells PF数 %PF = 44 Total Wells数

  45. Slide 45: ライブラリー濃度による%PFの変動

    ライブラリー濃度による%PFの変動 ライブラリー濃度 過少 通常範囲 過多 ウェルの状態 %PF 45 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  46. Slide 46: %Occupancy・%Occupied

    %Occupancy・%Occupied: クラスターが形成されたウェルの割合を示す指標 ポリクローナルウェルなど、塩基配列を決定できないクラスター も含む 空のウェル ポリクローナルウェル モノクローナルウェル Occupied Wells Total Wells Occupied Wells数 %Occupancy = 46 Total Wells数

  47. Slide 47: ライブラリー濃度による%Occupancyの変動

    ライブラリー濃度による%Occupancyの変動 ライブラリー濃度 過少 通常範囲 過多 ウェルの状態 %Occupancy 47 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  48. Slide 48: パターン化フローセルの場合の診断方法

    パターン化フローセルの場合の診断方法 ライブラリー濃度が過剰量または非常に少ないとデータに影響するため、下記マトリック スの傾向の組み合わせをSAV、BaseSpace Sequence Hub、または装置25サイクル後の Control Software画面で確認し評価することが望ましい - %Occupancy - %Passing filter - % ≧Q30 ※ iSeqとNovaSeq 6000パターン化フローセルの場合はクラスター密度が固定されている 48

  49. Slide 49: パターン化フローセルの場合の診断方法

    パターン化フローセルの場合の診断方法 下図はiSeqとNovaSeqのラン結果に基づいた%Occupancyと%PF metricsの相関図 フローセルに過剰量ライブラリーがローディングされた状態だと%Occupancyが高く、%PFが下がる傾向 49 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  50. Slide 50: 本ウェビナーのアジェンダ

    本ウェビナーのアジェンダ 1 クラスター形成とは？クラスターとは？ 最適なクラスター密度の重要性とは？ 2 - Overclustering と Underclusteringが与える影響 - 3 一般的にみられるクラスタリングに関する問題への回避策 4 ランダムフローセルにおける最適なクラスタリングの診断方法 5 パターン化フローセル（ iSeq・NovaSeq ） 6 サポート資料 50 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  51. Slide 51: クラスター密度の最適化に関する最新版ガイド

    クラスター密度の最適化に関する最新版ガイド https://jp.support.illumina.com/downloads/cluster-optimization-overview-guide-1000000071511.html 51 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  52. Slide 52: 装置に関するサポートページ

    装置に関するサポートページ https://jp.support.illumina.com/ 52 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  53. Slide 53: 関連ウェビナー

    関連ウェビナー PCRアンプリコンDNAライブラリーなどのLow Diversityサンプルのシーケンスランを 成功させるコツ https://jp.illumina.com/events/webinar/2019/webinar-191120-j.html SAV（Sequencing Analysis Viewer）でランの評価と改善を行う【イルミナiSchool 初級】 https://jp.illumina.com/events/webinar/2017/webinar_170614_j.html 53 For Research Use Only. Not for use in dia

  54. Slide 54: その他サポート資料

    その他サポート資料 Library quantification and quality control quick reference guide https://jp.support.illumina.com/bulletins/2016/05/ library-quantification-and-quality-control-quick- reference-guide.html?langsel=/jp/ Support Bulletins https://jp.support.illumina.com/bulletins.html?langsel=/jp/ - Cluster De

  55. Slide 55: 参考資料

    参考資料 55 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  56. Slide 56: %Occupancy vs %PF相関図の描き方

    ％Occupancy vs %PF相関図の描き方 56 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

  57. Slide 57: For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

    57 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

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