Slide 1: NextSeq2000のご紹介
イルミナ株式会社オンラインセミナー フレキシブルで低コストな研究プロ ジェクトを可能にする新商品 NextSeq2000のご紹介 シニアアプライドゲノミクススペシャリスト 小林 孝史| 2020/05/12, 21 本ウェビナーは2回同内容で行います 1
Slide 2: 本日のウェビナーの内容
本日のウェビナーの内容 ● NextSeq 2000の価格、仕様情報 ● NextSeq 2000の技術情報 2 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 3: イルミナ次世代シーケンサーは全世界で15,000台以上の導入実績
イルミナ次世代シーケンサーは全世界で15,000台以上の導入実績 （~2019年末） 2020年1月JP Morganカンファレンスでの発表より 3
Slide 4: 現在販売中のイルミナシーケンサー
現在販売中のイルミナシーケンサー 少 1ラン当たりのデータ量 多 2020年1月発表 新製品 ライブラリー調製は全機種共通 NextSeqTM 2000 iSeq™ 100 MiniSeq™ MiSeq™ NextSeq™ 550 NovaSeq™ 6000 16S rRNAアンプリコンシーケンス ショットガンメタゲノム解析、RNA-seq 単離菌の解析、遺伝子パネル シングルセル解析、全エキソーム、全ゲノム解析 4 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 5: NextSeq 2000 価格とフローセル
2020年1月発表 NextSeq 2000 4,422万円 受注開始 *初期6ヶ月はパイプライン無償試用期間あり *以降，DRAGENライセンス 99万円/年間 *FASTQ生成はライセンスの有無に関わらず可能 P2 Flow Cell* P3 Flow Cell** ~120Gb ~300Gb 18.7~46.7万円 42.9~79.2万円 100, 200, 300 cycle スキャン領域 100, 200, 300 cycle 計6キット販売予定 *価格は2020年5月時点 **2020年 第4四半期にリリース予定 5 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 6: 2020年内にNextSeq 1000をリリース予定
2020年内にNextSeq 1000をリリース予定 NextSeq 2000 NextSeq 1000 3千万円前後予定* 4,422万円 2020年第4四半期 2020年1月販売 予定 P2 Flow Cell P3 Flow Cell** P2 Flow Cell 購入後フィールドにて 120Gb 300Gb 120Gb NextSeq 2000に 最大データ量 最大データ量 最大データ量 アップグレード可能 **2020年 第4四半期にリリース予定 6 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 7: 超高密度フローセルにより大幅な性能向上とフレキシブルな出力を実現
超高密度フローセルにより、大幅な性能の向上と フレキシブルな出力を実現 NextSeq 2000のみで使用可能 NextSeq 1000/2000で使用可能 2020第4四半期 販売中 P3 Flow Cell ≥ 75% Q30 ≥ 75% Q30 P2 Flow Cell クオリティー ~ 1000M ~ 400M リード数 100 - 300Gb 40 - 120Gb データ量 ~ 48 Hrs ~ 29 Hrs ラン時間 2,640~ 円/Gb 3,894 ~円/Gb 円/Gb 7 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 8: NextSeq 2000 キット価格一覧（2020年5月現在）
NextSeq 2000 キット価格一覧（2020年5月現在） 販売予定価格 1Gあたりの G/NextSeq550 1Mクラスターあた M/NextSeq 550 キット価格 (円)* コスト（円） 削減 りのコスト 削減 P2 100 cycles 187,400 4,685 46% 469 28% (40G) 2020年 P2 200 cycles 第1四半期 352,400 4,405 47% 881 29% リリース (80G) P2 300 cycles 467,300 3,894 41% 1,168 41% (120G) P3 100 cycles 429,000 4,290 5
Slide 9: NextSeqシリーズはNovaSeq 6000とベンチトップNGSの間をつなぐ
NextSeqシリーズはNovaSeq 6000とベンチトップNGSの間を つなぐ ｺｽﾄ(円)/G Platform Flow Cell ¥/G (300 cycle kit) (300 CYC.) NovaSeq 6000 SP 2,466 NextSeq 2000 P3 2,640 NextSeq 1000/2000* P2 3,894 NextSeq 550 HO 6,627 NextSeq 550 MO 7,608 MiSeq v2 37,798 *NextSeq 1000/2000は予定価格から算出 $0 $50 $100 $150 $200 9 製品の使用目的は研究に限定されます
Slide 10: NextSeq 1000/2000でよりフレキシブルな解析が可能
NextSeq 1000/2000でよりフレキシブルな解析が可能 *2020年第4四半期予定価格 NextSeq 2000 300 Gb | 2,640円/Gb* NextSeq 1000 よりたくさんの 120 Gb | 3,894円/Gb サンプル NextSeq 550 120 Gb | 6,627円 /Gb MiSeq 新しい アプリケーション 15 Gb | 17,880円/Gb シングルセル解析 トリオ解析 ctDNA より深いデプス エキソーム解析 NIPT RNA-Seq がんパネル NIPT 濃縮パネル がんパネル 遺伝子パネル パネル 濃縮パネル Small genomes
Slide 11: NextSeq 500/550とNextSeq 2000の比較
NextSeq 500/550とNextSeq 2000 の比較 NextSeq 500/550 HO NextSeq 2000 *2020年第4四半期予定価格 120 Gb データ量 / ラン 300 Gb スループット 4.13 Gb / 時間 （データ量 / 日） 6.25 Gb / 時間 29 時間 ラン時間 48 時間 (1~ 日) (2 日) Gbあたりの 6627 円 / Gb 解析コスト 2640 円 / Gb 2 タイプ フローセル 2 タイプ の種類 11 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 12: HiSeq v3とNextSeq 2000の比較
HiSeq v3 とNextSeq 2000 の比較（1フローセル） HiSeq v3 NextSeq 2000 *2020年第4四半期予定価格 300 Gb データ量 / ラン 300 Gb スループット 1.14 Gb / 時間 （データ量 / 日） 6.25 Gb / 時間 264 時間 ラン時間 48 時間 (11 日) (2 日) Gbあたりの 9150 円 / Gb 解析コスト 2640 円 / Gb 2 タイプ フローセル 2 タイプ の種類 12 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 13: HiSeq v4とNextSeq 2000の比較
HiSeq v4 とNextSeq 2000 の比較（1フローセル） HiSeq v4 NextSeq 2000 *2020年第4四半期予定価格 500 Gb データ量 / ラン 300 Gb スループット 3.47 Gb / 時間 （データ量 / 日） 6.25 Gb / 時間 144 時間 ラン時間 48 時間 (6 日) (2 日) Gbあたりの 6044 円 / Gb 解析コスト 2640 円 / Gb 2 タイプ フローセル 2 タイプ の種類 13 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 14: 本日のウェビナーの内容
本日のウェビナーの内容 ● NextSeq 2000の価格、仕様情報 ● NextSeq 2000の技術情報 14 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 15: NextSeq 2000装置の外観
NextSeq 2000装置の外観 大きさ: 60 cm (H) x 60 cm (W) x 65 cm (D) 重さ: 141 kg 15-30 ℃ （結露がない条件） ● Ethernet/USB3.0/USB2.0がそれぞれ2ポートずつ装備 参照: NextSeq 2000 Sequencing System Guide (# 1000000109376 v00) 15 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 16: ランのセットアップ
ランのセットアップ 16 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
Slide 17: カートリッジ・フローセルの外観
カートリッジ・フローセルの外観 フローセル（4℃で出荷） 乾燥した状態で出荷 室温で10-15分放置後 カートリッジ（-20℃で出荷） 使用 使用前にカバーに入ったまま 25℃ウォーターバス、冷蔵庫、 室温で溶解し使用 参照: NextSeq 2000 Sequencing System Guide (# 1000000109376 v00) 17 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 18: ライブラリーのアプライ量
ライブラリーのアプライ量: ● 装置内でライブラリーの変性希釈が自動で行われる設計。 ● 調製したライブラリーを650 pM 20 µlを目安に希釈してセット(iSeq 100 は60 pM, 20 µl)。 参照: NextSeq 2000 Sequencing System Guide (# 1000000109376 v00) 18 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 19: NovaSeq Performance and Data Quality
NovaSeq Performance and Data Quality ランモニター時のウインドウ、ラン時間 クラスター形成: 3h 40m シーケンス: 6 min/cycle ペアエンド反転: 45 min 19 For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
Slide 20: 2チャンネルSBS BioIT Platformの新しい技術を搭載
> 75 の新しい技術を搭載 青・緑蛍光を使用した 高解像度の光学系 超高密度 内蔵DRAGEN 単一化された 20 2チャンネルSBS 整列化フローセル BioIT Platform カートリッジ
Slide 21: NextSeq 2000を支える3つの主要テクノロジー
NextSeq 2000を支える3つの主要テクノロジーが導く 30倍以上のデータ密度、データ量の向上、シーケンスコストの低下 NextSeq 550 NextSeq 2000 青・緑色蛍光を 超高解像度の HighOutput Flow Cell 整列化フローセル 使用した2色 光学系 P3 Flow Cell SBS 約31倍の密度で クラスター作成が 可能に ~200K ~6250K CLUSTERS/MM2 CLUSTERS/MM2 21 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 22: 超高解像度システムにより廃棄物の最小化、操作性が向上
超高解像度システムにより、廃棄物の最小化、操作性が NextSeq 550に比べ格段に向上 2.5× 2× データ Gb当た 4× 量 試薬の りの 小型化 価格 120Gb 300Gb 650 in3 ~160 in 3 NextSeq 550 NextSeq 2000 NextSeq 550 NextSeq 2000 NextSeq 550 NextSeq 2000 22 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 23: カートリッジの再設計による効率改善とコスト削減
カートリッジの再設計により、大幅な効率の改善とコスト削減を 実現 1/10 の試薬量、シーケンスコストと廃液の最小化 70% off 試薬キットのパーツ削減により、 キットサイズの最小化と効率的なデザインを実現 単一の 条件で試薬キットの保存が可能に パーツの分別が可能な試薬キット のデザインを採用し、廃棄しやすい設計に ライブラリーの変性も装置内で可能 廃液トレーが撤廃 23 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 24: NextSeq 2000はDRAGEN Bio-IT Platformを内蔵した最初のシステム
NextSeq 2000はDRAGEN Bio-IT Platformを内蔵した最初のシステム DRAGEN Bio-IT platformとは？ • Edico Genomeが開発したFPGAチップ • 精確性が高く高速な解析が可能 • コスト効率性が良い • 業界標準 リリース時搭載 Pipelines: Workflow: DRAGEN Enrichment Instrument Run Setup Tool DRAGEN RNA Automated Secondary Analysis DRAGEN Germline Automated Analysis File Downloads
Slide 25: NextSeq 2000にプリインストールされているゲノム参照配列
NextSeq 2000にプリインストールされている ゲノム参照配列 • Human UCSC hg19 Custom Alt Aware • Human UCSC hg19 Custom Alt Aware No Alt Haps No Decoys • Human NCBI hs37d5 • Human 1000 Genomes hg38 Alt Aware • Human 1000 Genomes hg38 Noalt with Decoys • Mouse mm10 • Rat rn6 • PhiX • Zebrafish JQCY02 • R. Sphaeroides 2.4.1 •
Slide 26: DRAGENで出力されるメトリックス
DRAGENで出力されるメトリックス The DRAGEN Platform Produces a Robust Portfolio of Metrics Library Prep QC Analysis QC Demultiplexing Duplicate Reads Raw Data Processing ● マッピング結果までカバーするQCデータを自動で出力し確認可能。 ● FASTQファイル作成までは無料でDRAGENを使用し行われる。 26 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 27: FASTQ作成までのDRAGEN解析は無料
ワークフローの刷新により イルミナで最も使いやすいシステムを実現 ラン条件の設定 シーケンス 解析 内蔵ソフトウェア ラン時に内蔵DRAGENで 装置内あるいは あるいはBaseSpaceでランのセットアップ 高速同時解析が可能 BaseSpaceでの解析パイプラインを使用 FASTQ作成までのDRAGEN解析は無料 二次解析のDRAGEN使用は年定額 27 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 28: NextSeq 2000の技術革新による性能向上とコスト低下
NextSeq 2000に搭載された技術革新は 顕著なパフォーマンスの向上とランニングコストの低下につながる 2x 4x 2.5x 6x 3x データあたりの運用 試薬キットのサイズが NextSeq 550に比べて の速度で二次解析が可能 データまでの操作 コストを節約 小さく NextSeq 2000 P3 Reagents ステップが削減 のデータ量が2.5倍に 28 28 製品の使用目的は研究に限定されます。
Slide 29: NextSeq 2000は大規模な研究にも拡張可能
NextSeq 2000は大規模な研究にも拡張可能 RNA-seq, シングルセル解析, Exome-seq, NextSeq 1000/2000 NextSeq 2000 P2 Flow Cell P3 Flow Cell 大規模パネル、全ゲノム解析などに使用可能 シングルセル発現解析 100 10 S AM P L E S 25 S AM P L E S 4000 cells | 10,000 reads/cell CYCLE ¥18,740 / S AM P L E S ¥17,160 / S AM P L E S 全エキソームシーケンス解析 200 16 S AM P L E S 40
Slide 30: 弊社BaseSpace Seq Hubにてデモデータを公開
弊社BaseSpace Seq Hubにてデモデータを公開 ● AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer Panel (Paired End 150 cycle) - Run: https://ilmn.basespace.illumina.com/s/qTrqhvYmufTC - Analysis: https://ilmn.basespace.illumina.com/s/fghfE0w77EH9 ● Nextera Flex for Enrichment Exome (Paired End 101 cycle) - Run: https://i
Slide 31: まとめ: NextSeq 2000とは？
まとめ: NextSeq 2000とは？ 01 設計を一新し、これまでで最も操作性の高いNGS: 4422 万円 • 2種類のリード数のフローセル(P2/P3)を用意 • 100~300 cycleの6種類のキット • 変性作業等が不要、ラン間のキャリーオーバー無し • 最長48時間でラン終了 • NextSeq 550に比べて最大60%コスト削減（データ比） • （年内にNextSeq 1000もリリース予定） 02 内蔵DRAGEN Bio-IT platformによる高速解析 • Fastq作成までは無料、その他のパイプラインは年額制 • BaseSpaceも使用可能でフレキシブルな解析
Slide 32: イルミナウェブサイト上の資料
イルミナウェブサイト上の資料 ● NextSeq 2000 brochure - https://jp.illumina.com/content/dam/illumina- marketing/documents/products/datasheets/nextseq-1000-2000-spec-sheet-770-2019- 030.pdf ● NextSeq 2000 Sequencing System Guide - https://jp.support.illumina.com/content/dam/illumina- support/documents/documentation
Slide 33: Questions?
Questions? 資料に関するお問い合わせは tkobayashi@illumina.comまで 33 製品の使用目的は研究に限定されます。