Illumina, Inc. · NASDAQ:ILMN
Illumina — Technical Presentation (July 2019)
76 slides from Illumina's technical presentation, Jul 3, 2019
Slide 1: iSeq 100システムの概要とワークフロー
illumina iSeq™ 100システムの 概要とワークフロー © 2017 Illumina, Inc. All rights reserved.
Slide 2: 本日の内容
本日の内容 特徴 シーケンスの一般的な工程と基本原理 iSeq 100のシーケンスワークフロー Local Run Manager トラブルシューティング メンテナンス Illumina Proactive 補足情報 2
Slide 3: 特徴
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Slide 4: iSeq 100の仕様（2019年6月現在）
iSeq™ 100の仕様（2019年6月現在） リード数 リード長 400万 リード 2x150 base pairs ラン時間 データ量（総塩基数） 9–17.5 時間 1.2 giga bases 4
Slide 5: iSeq 100消耗品の特徴
iSeq™ 100消耗品の特徴 カートリッジ 消耗品類は使い捨てタイプ ▸試薬カートリッジとフローセルをセットで提供（iSeq 100 i1 Reagent） 試薬カートリッジ内にシーケンスに必要な試薬がすべて含まれる ▸ライブラリをロードするだけでシーケンスが可能 流路がカートリッジ内で完結している ▸iSeq 100本体には流路系がないためラン後のウォッシュは不要 ▸以前解析したシーケンスサンプルが残存する心配がない フローセル 5
Slide 6: シーケンスの一般的な工程と基本原理
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Slide 7: シーケンスの工程
シーケンスの工程 ライブラリ調製：DNAをシーケンス可能な構造にする 装置内で自動的に行われる クラスター形成：ライブラリが増幅される シーケンシング：塩基配列情報（蛍光画像）が取得される 解析：蛍光画像をもとに塩基配列を決定＋任意の解析が実行される 7
Slide 8: シーケンスの工程
シーケンスの工程 ライブラリ調製：DNAをシーケンス可能な構造にする 装置内で自動的に行われる クラスター形成：ライブラリが増幅される シーケンシング：塩基配列情報（蛍光画像）が取得される 解析：蛍光画像をもとに塩基配列を決定＋任意の解析が実行される 8
Slide 9: ライブラリ調製：DNAをシーケンス可能な構造にする
ライブラリ調製：DNAをシーケンス可能な構造にする ライブラリ調製の一般的な流れ 核酸（DNA, RNA） 断片化DNA ライブラリ 200~600 bp アダプター 程度へ断片化 配列の付加 ※RNAを材料とする場合は断片化前に逆転写が必要 ライブラリの構造 ① ④ ② ③ ② ④ ① ①P5/P7: フローセルとの結合用配列 ②Rd1 SP/Rd2 SP: シーケンスプライマー結合用配列 ③DNA Insert: 解析したい核酸（200~600 bp程度） 9 ④Index1/Index2: サンプル区別のためのインデックス（バーコード）配列
Slide 10: イルミナ製ライブラリ調製キットの検索ツール
イルミナ製ライブラリ調製キットの検索ツール https://jp.illumina.com/library-prep-array-kit-selector.html 10
Slide 11: シーケンスの工程
シーケンスの工程 ライブラリ調製：DNAをシーケンス可能な構造にする 装置内で自動的に行われる クラスター形成：ライブラリが増幅される シーケンシング：塩基配列情報（蛍光画像）が取得される 解析：蛍光画像をもとに塩基配列を決定＋任意の解析が実行される 11
Slide 12: クラスター形成：ライブラリが増幅される
クラスター形成：ライブラリが増幅される ● クラスターとは1分子由来のライブラリから増幅されたDNA鎖の集団 ● 本工程の目的は1分子由来のライブラリを装置が検出可能な分子量ま で増やすこと ● １フローセルあたり400万クラスターほど形成（400万ヶ所でクラス ターが作られる） ● 本ウェビナーでは形成されたクラスターの数＝リード数と定義 12
Slide 13: iSeq 100ではパターン化フローセルを採用
iSeq™ 100ではパターン化フローセルを採用 従来のフローセル（ランダムフローセル） 新しいフローセル（パターン化フローセル） • HiSeq 2500, MiSeq, NextSeq, MiniSeqで • HiSeq 3K/4K/X, NovaSeq, iSeq 100で採用 採用 • クラスターが決まった位置（ナノウェル内）で増幅 • クラスターがランダムな位置で増幅 • クラスターがランダムフローセルよりも高密度化 ナノウェル ※白い点がクラスター iSeq 100フローセル HiSeq 2500フローセル HiSeq 3K/4K/Xフローセル 13
Slide 14: パターンフローセルにおけるクラスター形成の原理
パターンフローセルにおけるクラスター形成の原理 -解説動画公開中 https://www.youtube.com/watch?v=pfZp5Vgsbw0 14
Slide 15: シーケンスの工程
シーケンスの工程 ライブラリ調製：DNAをシーケンス可能な構造にする 装置内で自動的に行われる クラスター形成：ライブラリが増幅される シーケンシング：塩基配列情報（蛍光画像）が取得される 解析：蛍光画像をもとに塩基配列を決定＋任意の解析が実行される 15
Slide 16: Sequencing By Synthesis (SBS)法
シーケンシング：塩基配列情報（蛍光画像）が取得される Sequencing By Synthesis (SBS)法 ・可逆的ターミネーターを用いて一塩基ずつシーケンスする ・1反応毎に蛍光ラベルされた 4ヌクレオチドを加える（蛍光の種類で塩基を特定） ・3’末端に保護基があるためDNA合成と蛍光検出をstep by stepで進められる ・高精度で信頼があり、ホモポリマー領域も正確に解析できる O O X 5’ HN HN cleavage site fluor DNA O N O N O 次サイクルの O PPP O SBS反応 ①ヌクレオチド取り込み ②検出 3’ 3’ OH free 3
Slide 17: SBS法の詳細 - 日本語ウェブセミナー公開中
SBS法の詳細 - 日本語ウェブセミナー公開中 https://jp.illumina.com/events/webinar/2018/webinar-181128-j.html 17
Slide 18: iSeq 100におけるシーケンシング
iSeq™ 100におけるシーケンシング 1 シーケンスサイクル A + T C T G G 塩基取り込み 1画像目の取得 化学反応 2 画像目の取得 X サイクル数（bp） 保護基と蛍光色素の除去 18
Slide 19: iSeq 100における塩基決定
iSeq™ 100における塩基決定 Base Image 1 Image 2 C Intensity Image 2 T ON ON T A ON OFF C OFF ON G OFF OFF G A Image 1 Intensity ● iSeq 100 システムは 1 色素シーケンシングを使用 ● 上記の表に従って4 つの塩基を1色素と2画像で決定 19
Slide 20: イメージング原理：CMOSセンサーの利用
イメージング原理：CMOSセンサーの利用 ● クラスタ－は単色の光源で励起される ● 各クラスターには、CMOS 内に関連付けられたセンサーがある→イメージングの簡略化 ※(CMOS：Complementary metal–oxide–semiconductor) 単色の励起光 ガラス面 流路 フローセル Cluster ナノウェル 光学フィルター COMSフォトダイオード 20
Slide 21: シーケンスの工程
シーケンスの工程 ライブラリ調製：DNAをシーケンス可能な構造にする 装置内で自動的に行われる クラスター形成：ライブラリが増幅される シーケンシング：塩基配列情報（蛍光画像）が取得される 解析：蛍光画像をもとに塩基配列を決定＋任意の解析が実行される 21
Slide 22: 解析：蛍光画像をもとに塩基配列を決定
解析：蛍光画像をもとに塩基配列を決定＋任意の解析が実行される Local Run Mangerモード Manualモード Local Run Manger ラン条件、サンプル情報、解析ワークフロー指定 iSeq Control Software 設定情報呼び出し ラン条件のみ設定 一次解析（画像取得、画像解析、塩基決定） Local Run Manger/BaseSpace Sequence Hub Linux環境 二次解析（FASTQの作成と設定に応じた解析） FASTQの作成等 22 レポート表示
Slide 23: iSeq 100でのアプリケーション例
iSeq™ 100でのアプリケーション例 https://jp.illumina.com/events/webinar/2018/new-product-webinar-iseq-0207.html 23
Slide 24: iSeq 100のシーケンスワークフロー
iSeq 100M2—7LYAI—Z IA— SKGACOCTIAACCTTAATCATINSTONN GAGTAATTCTTGCCTCTICATAGSN GGAATTGGAATIAG GROWS csi ot 3) ARN << UURTTRCCENTON I a illumina’
Slide 25: iSeq 100のシーケンスワークフロー
iSeq 100のシーケンスワークフロー ラン作成 Local Run Managerモード で使用の場合 マニュアルモー ドで使用の場合 解凍 希釈 ロード Create Run Local Run Manager で作成した （装置内）で二次解析 ランを選択 Linux環境（装置外） で二次解析 サイクル数 ※fastqの作成も必要 をマニュア ランセットアップ ラン開始 ル入力 25
Slide 26: iSeq 100のシーケンスワークフロー
iSeq 100のシーケンスワークフロー ラン作成 Local Run Managerモード で使用の場合 マニュアルモー ドで使用の場合 解凍 希釈 ロード Create Run Local Run Manager で作成した （装置内）で二次解析 ランを選択 Linux環境（装置外） で二次解析 サイクル数 ※fastqの作成も必要 をマニュア ランセットアップ ラン開始 ル入力 26
Slide 27: Local Run Managerでのラン作成
Local Run Managerでのラン作成 Create Run→解析モジュールの順にクリック ラン条件とサンプル情報を入力 ※ランセットアップの詳細は下記ウェビナーで紹介 https://jp.illumina.com/events/webinar/2019/webi nar-190422-j.html 27
Slide 28: iSeq 100のシーケンスワークフロー
iSeq 100のシーケンスワークフロー ラン作成 Local Run Managerモード で使用の場合 マニュアルモー ドで使用の場合 解凍 希釈 ロード Create Run Local Run Manager で作成した （装置内）で二次解析 ランを選択 Linux環境（装置外） で二次解析 サイクル数 ※fastqの作成も必要 をマニュア ランセットアップ ラン開始 ル入力 28
Slide 29: 試薬の融解
試薬の融解 ● ホイルバッグに入れたまま試薬カートリッジ（-20℃保存品）を溶かす ● 下記いずれかの方法で融解させる： 方法 融解時間 安定限界 手順 ・ウォーターバスに十分量の水を準備する 20℃ ～ 25℃、 6 時間 ～18 時間 ・ウォーターバスを 25℃にセットするか水温を 20℃ ～ 25℃になる ように準備する ウォーターバス ・カートリッジをラベルが上に向くように完全に沈め、おもりを乗せて浮かんでこないようにする 4℃ ～ 8℃、 36 時間 ～72 時間 ・ ラベルが上を向くようにカートリッジを置き、底面を含むすべての面が空気が循環するようにする 冷蔵庫 室温、 9 時間
Slide 30: iSeq 100のシーケンスワークフロー
iSeq 100のシーケンスワークフロー ラン作成 Local Run Managerモード で使用の場合 マニュアルモー ドで使用の場合 解凍 希釈 ロード Create Run Local Run Manager で作成した （装置内）で二次解析 ランを選択 Linux環境（装置外） で二次解析 サイクル数 ※fastqの作成も必要 をマニュア ランセットアップ ラン開始 ル入力 30
Slide 31: シーケンスのためのライブラリの準備
シーケンスのためのライブラリの準備 ● ライブラリを 1 nM に希釈する - Resuspension buffer (RSB) もしくは10mM Tris-HCl, pH 8.5を使用して希釈する ● 適切なローディング濃度に希釈した 100 µl のライブラリ溶液を準備する： - 上記リストにないタイプのライブラリでは 50 pM のローディング濃度から開始し、 次回以降のランで最適化を行っていく 31 ※最適なローディング濃度はライブラリタイプにより変動する
Slide 32: PhiXのスパイクインについて
PhiXのスパイクインについて ● PhiX とは? - ウィルス由来の短くて配列の判っているコントロールライブラリ ▪ 追加の統計情報、塩基出現の多様性の付与、シーケンスのポジティブコントロール、 といった利点をもたらす - RSB で PhiX を 1 nM に希釈する - 添加するライブラリと同じ濃度に PhiX をさらに希釈する： - 2 µl の希釈済 PhiX を、100 µl の希釈ライブラリに加えることで~2% PhiX spike-in となる ▪ シーケンシングデータにおける PhiX の実際の割合は、ライブラリの品質と量によって 異なる 32
Slide 33: iSeq 100のシーケンスワークフロー
iSeq 100のシーケンスワークフロー ラン作成 Local Run Managerモード で使用の場合 マニュアルモー ドで使用の場合 解凍 希釈 ロード Create Run Local Run Manager で作成した （装置内）で二次解析 ランを選択 Linux環境（装置外） で二次解析 サイクル数 ※fastqの作成も必要 をマニュア ランセットアップ ラン開始 ル入力 33
Slide 34: カートリッジへのロード
カートリッジへのロード ● パッケージを破って開封 ● 5回転倒混和し、机に軽く叩きつけ泡 抜き ● ライブラリのロード - ピペットチップを使用してライブラリ リザーバーのホイルに穴を開ける - 20 µl のライブラリをリザーバーの底 に加える ● フローセルのロード - フローセル（4℃保存品）は結露を防 ぐために冷蔵庫から取り出したあと袋 のまま室温に 10-15 分置いておく 34
Slide 35: iSeq 100のシーケンスワークフロー
iSeq 100のシーケンスワークフロー ラン作成 Local Run Managerモード で使用の場合 マニュアルモー ドで使用の場合 解凍 希釈 ロード Create Run Local Run Manager で作成した （装置内）で二次解析 ランを選択 Linux環境（装置外） で二次解析 サイクル数 ※fastqの作成も必要 をマニュア ランセットアップ ラン開始 ル入力 35
Slide 36: ランセットアップ
ランセットアップ ● Sequence を選択 ● 消耗品をロード 36
Slide 37: セットアップ – BaseSpace Sequence Hubを使用する場合
セットアップ – BaseSpace Sequence Hubを使用する場合 ● BaseSpace Sequence Hub にログインする ● Run Monitoring Only ▪ リモートでのモニタリングのためにランメトリックのみ送信 ● Run Monitoring and Storage ▪ BaseSpace Sequence Hub にランデータを送信し、 リモートでのモニタリングに加えて解析も可能 – このオプションではサンプルシートが必要となる ※上記設定が必要ない場合はSkip BasseSpace Sequence Hub Log inをクリック 37
Slide 38: セットアップ- Local Run Manager Mode
セットアップ- Local Run Manager Mode ● ランを選択し、Start Runをクリック - 設定していたランを選ぶ（ラン条件が出てこない場合は をクリック） ※ユーザー管理機能をオンにしている場合はログインが求められる 38
Slide 39: セットアップ – Manual Mode
セットアップ – Manual Mode ● ランパラメーターを設定し、Start Runをクリック - >Advanced を選択することで、アウトプットフォルダの編集や個々のライブラリの インデックス情報を持つサンプルシートを加えることができる ▪ テンプレートをダウンロードしてファイル名を SampleSheet.csv とする必要がある 39
Slide 40: プレランチェック
プレランチェック ● Start Runをクリックするとプレランチェックが自動的に開始 - この工程内のFlow checkで、カートリッジ内のシールに穴が開けられ バッファーがフローセルに流し込まれる ▪ Flow check以降は消耗品の再利用は不可 - プレランチェックにはおおよそ15 分かかる - ランはプレランチェックが正常に完了すると自動で開始される 40
Slide 41: ランモニタリング
ランモニタリング ランメトリック: 完了予定時刻: ・%Q30 リード長によ ・予想出力塩基数 り決定される (25 サイクル以降表示) ※Control Software v1.4以降は 上記に加え%Clusters PF, %Occupancyが表示 一度キャンセルを選択 すると再開はできない ● Paired-end 2x151 bp, dual index 8+8 ランはおおよそ 17.5 時間かかる 41
Slide 42: iSeq ラン後の手順
iSeq 100 ラン後の手順 ● ランが完了したら、[Eject Cartridge] を選択する ● フローセルとカートリッジを自治体や施設に適用される基準 に従って廃棄する（廃液タンクはカートリッジ内蔵） 42
Slide 43: iSeq 100のシーケンスワークフロー
iSeq 100のシーケンスワークフロー ラン作成 Local Run Manager モード で使用の場合 マニュアルモード で使用の場合 解凍 希釈 ロード Create Run Local Run Manager で作成したラ （装置内）で二次解析 ンを選択 Linux環境（装置外） で二次解析 サイクル数を ※fastqの作成も必要 マニュアル入 ランセットアップ ラン開始 力 43
Slide 44: 解析状況・結果の閲覧
解析状況・結果の閲覧 ● Local Run MangerのDashboard から解析状況の確認が可能 ● 解析結果は該当するランを選択することで閲覧可能 44
Slide 45: 解析結果
解析結果 Run Overview Sequencing Information Samples and Results 45
Slide 46: ランフォルダはどこにある？（デフォルト設定）
ランフォルダはどこにある？（デフォルト設定） ● ランごとに2つのランフォルダが作成される -ひとつ目はD:¥Illumina¥iSeq Runs -ふたつ目はD:¥SequencingRunsあるいは指定されたネットワークに作成 ● マニュアルモードでランをした場合は、上記保存先からランフォルダを丸ごと コピーし、別途Linux環境でfastq作成を行う必要がある 46
Slide 47: 解析結果はどこにある？（Generate FASTQの場合）
解析結果はどこにある？（Generate FASTQの場合） ● 出力ファイルと出力先は解析モジュール毎 に異なる - 各解析モジュールのWork Flow Guideを参照 ● Generate FASTQの場合、fastqファイル出 力先は、左記のフォルダ構造（デフォルト 設定） ● Local Run Manager内「Output Run Folder」がランフォルダの場所を示す 47
Slide 48: Local Run Manager
Local Run Manager Illumina
Slide 49: Local Run Manager
Local Run Manager ● 装置内蔵のソフトウェアソリューション ● ベンチトップ型シーケンサー用にデザイン : - iSeqTM 100以外にMiniSeqTM, MiSeqTM, NextSeqTM 500/550のデータ 解析にも対応 ● Windows ベース（Windows 7および10と互換性あり） - 装置外のwindows PC にもOff-Instrumentとしてインストール可能 ユーザー 管理 ラン作成 (オプション) シーケンス 結果閲覧 データ解析 49
Slide 50: iSeqにインストールされているLocal Run Managerの特徴
iSeqにインストールされているLocal Run Manager の特徴 2.x 様々な解析モジュールをインストール可能 Generate FASTQ, DNA Amplicon, RNA Amplicon, Amplicon DS, DNA Enrichment, Resequencing, Small RNA, TST15 v2, PCR Amplicon, Assembly, 16S Metagenomics, Library QC →Local Run Managerサポートページから必要なモジュールのインストーラーをダウンロードし、インス トールを行う 注意点 ・iSeq 100は
Slide 51: 解析モジュールのインストール
解析モジュールのインストール http://jp.support.illumina.com/sequencing/sequencing_software/local-run- manager/downloads.html ↓Local Run Managerサポートページからインストーラーをダウンロード ↓装置Cドライブ直下のilluminaフォルダ内にインストーラーを移動 ↓インストーラーを立ち上げNextをクリック ↓Local Run Managerでユーザー管理機能をオフにしている場合はそのまま、 オンにしている場合はUser NameとPasswordを入力し、Nextをクリック ↓
Slide 52: Local Run Managerへのアクセス
Local Run Manager へのアクセス ● ウェブブラウザを介して閲覧する - 装置やインストールされた PC で直接 : http://localhost/ - 同じネットワーク内のウェブブラウザから : http://{ip address}/ - Chrome もしくは Chromium に最適化されている 52
Slide 53: Local Run Managerログイン後の画面-Run Dashboard
Local Run Managerログイン後の画面-Run Dashboard ● iSeq 100, MiSeq, Off-Instrument用のLocal Run Managerは 同一のプラットフォーム 装置名とバージョン ユーザー 53
Slide 54: Local Run Managerの詳細
Local Run Managerの詳細 ・Local Run Managerサポートページ ・ウェビナー http://jp.support.illumina.com/sequencing/sequ https://jp.illumina.com/events/webinar/2019/we encing_software/local-run-manager.html binar-190422-j.html 54
Slide 55: Local Run Managerではどのような解析が行われる？
Local Run Managerではどのような解析が行われる？ -各解析モジュールのWorkflow Guideに詳細が記載 http://jp.support.illumina.com/sequencing/sequencing_software/local- run-manager/documentation.html 55
Slide 56: トラブルシューティング
KG FY a—F4T7 Illumina
Slide 57: トラブルシュートの推奨ワークフロー
トラブルシュートの推奨ワークフロー Control Softwareがエラーを表示 エラーメッセージ画面をスクリーンショット等で保存し、 イルミナテクニカルサポートへ連絡 サポート担当者ご案内のもと、下記の実施にご協力いただく場合あり ・イルミナへのランクオリティデータやログファイルの送付 ・装置再起動 ・システムチェック 57
Slide 58: 再起動の方法
再起動の方法 側面電源ボ 装置の 背面の タンが点滅 側面の電源 メニュー : 30 秒 電源スイッ したら背面 ボタンを押 Shut Down 待機 チをオンに 電源をオフ す System する に 側面 背面電源 電源 スイッチ ボタン 58
Slide 59: システムチェックの方法
システムチェックの方法 必要なもの: • テストカートリッジ、テストフローセル ※どちらも再利用可能だが使用期限/使用限度に注意 （使用期限/使用限度は5年/35回の短い方） 方法: 59
Slide 60: 装置へのログインパスワードを忘れたらどうすればいい？
装置へのログインパスワードを忘れたらどうすればいい？ ● 装置へのログインパスワードはイルミナ側から確認・修正等が一切できない - 可能な限り忘れないパスワードを設定することを推奨 - 最終手段として装置を工場出荷状態へ戻すことでパスワードはリセットされるが作業が煩雑 ● 方法 - 装置を再起動し、「Restore to Factory Settings」 を選択 - 装置起動時に 5 秒間プロンプトが表示される - 確認の後、C:¥ ドライブが消去され、コントロー ルソフトウェアがアンインストールされる - iSeq Control Software をサポートページからダウ ンロードする
Slide 61: メンテナンス
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Slide 62: iSeq 装置メンテナンス
iSeq 100 装置メンテナンス HDD のクリーン ソフトウェアアップ 予防メンテナンス アップ デート 62
Slide 63: HDDのクリーンアップ
HDD のクリーンアップ ● ランデータを定期的に削除することを推奨 ● 各ランは ~2 GB の容量が必要 ● コントロールソフトウェアから選択 - Process Management を選択 - Delete Run を選択 ▪ アクティブなランは削除不可 ▪ 出力フォルダは削除不可 - ランの削除には Yes を選ぶ - Done を選んで作業を完了する 63
Slide 64: ソフトウェアアップデート
ソフトウェアアップデート ● パッケージ化されたシステムスイートと呼ばれるソフトウェアアップデー トで、下記が含まれている: - iSeq Control Software - iSeq 100 System Recipes - Real Time Analysis - Local Run Manager ● アップデートは自動または手動でインストールできる - オートマティックアップデートではインターネット接続が必要だが、BaseSpace Sequence Hubアカウントは必要ない ▪ アップデートが利用可能になると、コントロールソフトウェアメニューに通知のアイコンが 表示される - マ
Slide 65: 予防メンテナンス - エアフィルターの交換
予防メンテナンス - エアフィルターの交換 ● コントロールソフトウェアは、最初のセッ トアップから6ヶ月ごとにエアフィルタの 交換を促す 装置の裏側にある パネルを取り外す 新しいエアフィ 2 つのパネル 上部パネルの右側 ルターをパネル フックを装置に を押して外す にセットし、押 挿入し、所定の して固定 位置に押し込む 65
Slide 66: 予防メンテナンス - ドリップトレイの交換
予防メンテナンス - ドリップトレイの交換 ● まれなことではあるが、プレランチェックやシーケンス中に漏れが検出される - ソフトウェアはランを終了し、警告し、カートリッジを排出する ● 装置の底にあるドリップトレイによりカートリッジからの試薬漏れがキャッチ される - 通常状態ではドリップトレイは乾いている 装置前面 - トレイ上に液体が見える場合は、装置ガイドに従ってパッドを交換する - パッドの交換は年間保守の一環となる 66
Slide 67: Illumina Proactive
IIlumina Proactive illumina’
Slide 68: Illumina Proactiveとは
Illumina Proactiveとは ● 装置パフォーマンスデータの自動アップロード - トラブルが発生した際に、お客様にデータをお送りいただく負担を軽減し、弊社サポート チームによる迅速な診断を可能にする ● 装置の故障リスクの自動検出 - リスクを自動検出し、予防的な修理を弊社のサポートチームよりプロアクティブにご提案 ● Illumina Proactiveのメリット - ダウンタイムの軽減 - トラブルシューティングの効率化 - 時間・労力・試薬・サンプルの損失の低減 68
Slide 69: イルミナに送信される情報 - アップロードされるデータ
イルミナに送信される情報 - アップロードされるデータ サンプルや配列の情報はモニターされず、イルミナからアクセスできない ランパフォーマンス 装置の設定 ランの設定 • Q-scores • 装置シリアル番号 • ラン条件 収集されるデータ • エラーレート • ソフトウェアバージョン • 試薬ロット番号 • 装置ログ • 解析の設定とログ • ランのトラブルシュート • ランのトラブルシュート • 障害のリスク予測 目的 • ソフトウェアのトラブル • ソフトウェアのトラブル • 障害の検出 シュート シュート 69
Slide 70: Illumina Proactiveを有効にする方法 (Control Software v1.3)
Illumina Proactiveを有効にする方法 (Control Software v1.3) ● ホーム画面からSystem Settingsを選択 ● Run Modeタブを選択 ● None以外のいずれかをチェック -Run Monitoring and Storage: クラウドにシーケンスデータも送信したい場合 -Run Monitoring:リモートでのモニタリングのためにランメトリックのみ送信する場合 -Instrument Performance Data Only: 前ページ記載のデータのみをイルミナへ送る場合 70
Slide 71: Illumina Proactiveを有効にする方法 (Control Software v1.4以降)
Illumina Proactiveを有効にする方法 (Control Software v1.4以降) ● ホーム画面からSystem Settingsを選択 ● Settingsタブを選択→Set Up Manuallyをクリック ● Turn on illumina Proactive Supportをチェック 71
Slide 72: Illumina Proactiveについての詳細情報 – ウェブページ
Illumina Proactiveについての詳細情報 – ウェブページ https://jp.illumina.com/services/instrument- services-training/product-support- services/instrument-monitoring.html 72
Slide 73: 補足情報
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Slide 74: iSeq 100 Sequencing System Guide
iSeq 100 Sequencing System Guide http://jp.support.illumina.com/downloads/iseq-100-system-guide-1000000036024.html 74
Slide 75: Web-Based Trainings
Web-Based Trainings https://jp.illumina.com/systems/sequencing-platforms/iseq/how-to-start.html 75
Slide 76: サポートウェビナーにご参加いただきありがとうございました。
サポートウェビナーにご参加いただき ありがとうございました。 本日のセッション終了後のご質問は、 techsupport@illumina.com で承ります。 テクニカルサポート直通のフリーダイヤルも ご利用ください（AM9 – PM5）。 0800-111-5011 76